กลุ่มก่อการร้าย Haqqani Network เริ่มปรากฏในรายงานของหน่วยข่าวกรองที่ปฏิบัติการในอัฟกานิสถานและปากีสถานตั้งแต่ปี 2547-2548 ชื่อของเครือข่ายเกี่ยวข้องกับชื่อของผู้บัญชาการภาคสนามจาลาลุดดิน ฮักคานี ผู้ต่อสู้กับกองทัพโซเวียต
ระหว่างที่กองทหารโซเวียตอยู่ในอัฟกานิสถาน Jalaluddin Haqqani เป็นผู้บัญชาการภาคสนามที่มีชื่อเสียง เขาได้รับการสนับสนุนจาก US Central Intelligence Agency โดยให้ความช่วยเหลือทางการเงิน
หลังจากการถอนทหารโซเวียต สงครามกลางเมืองในอัฟกานิสถานยังคงดำเนินต่อไป Haqqani มีส่วนร่วมในการดำเนินงานหลักหลายครั้ง อำนาจของเขาเติบโตขึ้นอย่างมาก ในปีพ.ศ. 2535 เขามีส่วนร่วมในการเจรจาสันติภาพระหว่างฝ่ายต่างๆ ที่ทำสงคราม จากนั้นได้เป็นรัฐมนตรีว่าการกระทรวงยุติธรรมอัฟกานิสถานและดำรงตำแหน่งนี้เป็นเวลาสี่ปี
หลังจากการยึดกรุงคาบูลโดยกลุ่มตอลิบานในปี 2539 ฮักคานีเสียทางด้านข้างและได้รับแต่งตั้งเป็นรัฐมนตรีกระทรวงกิจการชายแดน ในทางปฏิบัติ สิ่งนี้นำไปสู่ความจริงที่ว่าเขาควบคุมจังหวัด Paktia อย่างสมบูรณ์ ซึ่งเป็นที่ตั้งของค่ายฝึกของอัลกออิดะห์ที่ถูกทำลายโดยชาวอเมริกันในเวลาต่อมา หลังจากเริ่มปฏิบัติการของสหรัฐฯ กับกลุ่มตอลิบาน ฮักคานีเริ่มสั่งกองกำลังติดอาวุธ แต่ไม่สามารถต้านทานผู้บุกรุกได้ กลุ่มตอลิบานพ่ายแพ้ Haqqani เริ่มทำสงครามกองโจรและในไม่ช้าก็ได้รับการตั้งชื่อโดยชาวอเมริกันให้เป็นหนึ่งในหกผู้ก่อการร้ายที่ต้องการมากที่สุดของตอลิบาน
การกระทำของ Haqqani ต่อกองกำลังของรัฐบาลและกองทัพสหรัฐฯ ประสบความสำเร็จอย่างมาก ตั้งแต่กลางทศวรรษ 2000 รายงานจากอัฟกานิสถานเริ่มพูดถึง "เครือข่าย Haqqani" ซึ่งบ่งชี้ถึงอิทธิพลที่เพิ่มขึ้นของขุนศึกรายนี้ ตั้งแต่ปีพ.ศ. 2549 พร้อมด้วยฮักคานี บุตรชายของเขา สิราจุดดิน (สิราช) ดูแลเครือข่าย ตั้งแต่ปีพ.ศ. 2550 ศิราชปกครองกลุ่มนี้เกี่ยวกับสุขภาพที่ทรุดโทรมของบิดา กลุ่มก่อการร้าย Haqqani มีส่วนเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับกลุ่มตอลิบาน อย่างไรก็ตาม ยังคงดำเนินการอย่างอิสระและไม่เคยยอมจำนนต่อใครเลย
ในไม่ช้า ความเป็นผู้นำของ "เครือข่าย Haqqani" ได้รวมสมาชิกหลายคนในครอบครัวของผู้ก่อตั้งและผู้บัญชาการภาคสนามจำนวนหนึ่ง กลุ่มควบคุมหลายจังหวัดของอัฟกานิสถาน ตั้งแต่ปี 2008 กลุ่มนี้เริ่มใช้ระเบิดพลีชีพเพื่อโจมตีผู้ก่อการร้าย ทางการสหรัฐฯ เริ่มมองว่าการโจมตีดังกล่าวเป็นภัยคุกคามต่อทหารอเมริกันในอัฟกานิสถานมากที่สุด จากข้อมูลของหน่วยข่าวกรอง จำนวนสมาชิกของเครือข่ายในปี 2010 อยู่ระหว่าง 4 ถึง 15,000 คน เป็นการยากที่จะประเมินจำนวนผู้ก่อการร้ายได้อย่างแม่นยำมากขึ้นเนื่องจากลักษณะปิดของกลุ่ม
ตั้งแต่ปี 2008 ลูกชายของผู้ก่อตั้งกลุ่ม Siraj Haqqani ถูกรวมโดยสหรัฐอเมริกาในรายชื่อผู้ก่อการร้าย ตั้งแต่ปี 2009 มีการประกาศรางวัล 5 ล้านดอลลาร์สำหรับข้อมูลเกี่ยวกับเขา ในปีถัดมา Nasiruddin Haqqani, Khalil al-Rahman Haqqani และ Badruddin Haqqani ถูกเพิ่มเข้าไปในรายชื่อผู้ก่อการร้าย
เป็นเวลานานที่ทางการสหรัฐฯ ไม่กล้ารวม "เครือข่ายฮักคานี" อย่างเป็นทางการในจำนวนกลุ่มก่อการร้าย เนื่องจากพวกเขายังคงหวังว่าจะบรรลุข้อตกลงกับผู้นำของขบวนการผู้มีอิทธิพลดังกล่าว หน่วยข่าวกรองของประเทศจัดการประชุมกับตัวแทนของเครือข่าย แต่พวกเขาล้มเหลวในการบรรลุข้อตกลงใด ๆ
ในที่สุดสถานการณ์ก็คลี่คลายในเดือนกันยายน 2011 เมื่อผู้ก่อการร้ายจากเครือข่าย Haqqani Network โจมตีสำนักงานใหญ่ของกองกำลัง NATO และสถานทูตสหรัฐฯ ในกรุงคาบูล 16 คนตกเป็นเหยื่อของการโจมตี เป็นที่ชัดเจนว่าจะไม่สามารถบรรลุข้อตกลงกับผู้ก่อการร้ายได้ และในเดือนกันยายน 2555 มีการประกาศว่าสหรัฐฯ ได้เพิ่มเครือข่าย Haqqani ลงในรายชื่อกลุ่มก่อการร้าย
